Prowadzone przez Związek Legionistów Polskich Muzeum Czynu Niepodległościowego w Krakowie ma zakaz działalności. Taką decyzję, ze względu na interes społeczny, podjął minister kultury i dziedzictwa narodowego.
Zdaniem MKiDN muzeum należy zamknąć w celu zabezpieczenia przed zagrożeniem zniszczenia lub kradzieży zbiorów oraz ze względu na konieczność zapewnienia bezpieczeństwa zwiedzających.
W muzeum znajdują się zbiory związane z historią Legionów Polskich oraz organizacjami patriotycznymi i niepodległościowymi. Można tu też oglądać pamiątki po marszałku Józefie Piłsudskim i marszałku Edwardzie Rydzu-Śmigłym.
Przeprowadzona w 2018 r. w muzeum kontrola wykazała szereg poważnych uchybień. Zalecenia pokontrolne – głównie z powodów finansowych – nie zostały zrealizowane. Zbiory Muzeum Czynu Niepodległościowego – zgodnie z zapisami listu intencyjnego – miało w takim przypadku przejąć Muzeum Narodowe, a Muzeum Czynu Niepodległościowego stałoby się jednym z oddziałów MN, zachowując dotychczasową nazwę i siedzibę. Związek Legionistów Polskich nie przekazał jednak MN zbiorów i nie podpisał z nim stosownych umów. W tej sytuacji ministerstwo wszczęło postepowanie administracyjne, którego efektem jest decyzja zakazująca MCN dalszej działalności.